Les deux seules guerres mondiales qu'ait connu l'humanité ont lieu au XX^e siècle ; alors que les conditions de vie sont contrecarrées et les effectifs réduits pendant ces périodes tragiques, les recherches scientifiques continuent.
L'Inra est fondé en 1946, après la seconde guerre, l'opinion et les gouvernants accordent de l'importance aux recherches scientifiques et il faut réorganiser l'agriculture française afin d'atteindre prioritairement les objectifs d'autosuffisance alimentaire pour la nation.
Le centre de recherche de l'Inra de Versailles est dévolu principalement à l'étude des sols et des végétaux, y sont améliorés, étudiés et expérimentés, par exemple les blé, lin, colza, pois ou maïs.
Une unité de recherche supplémentaire est crée en 1978 avec la station de Génétique Végétale du Moulon à Gif sur Yvette.
 
 

A partir des années 1957 le partenariat entre l'Inra et l'école de Grignon se matérialise par la présence de personnel et matériel Inra sur les installations et terres de l'école de Grignon. Dès les années 60 des Unités de Recherche, en partenariat avec l'Ecole de Grignon et l'INA Paris et/ou d'autres organismes de recherche, sont implantées sur les sites et constituent le Centre de Recherche Inra de Grignon.
 

En 1997, la fusion des deux centres Inra de Versailles et Inra de Grignon donne naissance au centre de recherche Inra Versailles-Grignon.
Un site supplémentaire pour le centre s'ouvre avec la création en 1999 de l'unité mixte de Génomique Végétale créee à Evry.

Le centre et ses unités évoluent sans cesse en fonction des avancées scientifiques et des pressions environnementales.